Egy meleg nyári napon ismeretlen érkezik egy tengerparti kisvárosba. Egyetlen célja ebben a pillanatban, hogy pénzhez és ételhez jusson, így egy különleges mutatvánnyal próbálkozik a helyi gyerekeknél, de nem arat osztatlan sikert. Magányosan alszik el hát a part mellett, ám ébredésekor egy különös lányt talál maga mellett, aki az eget bámulja.
Így kezdődik történetük és a nyár, amely mindkettőjük sorsát megpecsételi, az 1000. nyár.

Kunisaki Yukito egy lányt keres, egy olyan lényt, aki a felhők felett repül. Ezt a lényt kereste édesanyja és minden őse az elmúlt években. Anyja halála után ő indult el megkeresni, járja a világot és a bábozásból él meg.
Kamio Misuzu egy barátságos, naiv diáklány, aki azonnal elkövet mindent, hogy Yukitot közelebbről is megismerhesse, barátokká válhassanak. A lány kedvessége ellenére magányos, valamilyen furcsa oknál fogva nincsenek barátai. Nagynénjévelvel élnek egy házban, ám Haruko szinte sosincs otthon. Misuzu minden vágya, hogy barátokat találjon, és ezt a nyarat végre ne egyedül kelljen eltöltenie, ezért is kéri nagynénjét, had maradhasson Yukito-san náluk. Az asszonyt sikerül is meggyőzni, Yukitot tulajdonképpen babysitternek fogadja fel, hogy vigyázzon a lányra és szoktassa végre le egy bizonyos rossz szokásáról. Ami azonban leginkább felkelti a férfi érdeklődését, az hogy a lány különös dolgokról álmodik. Azt álmodja, hogy a felhők felett szárnyal, és úgy gondolja, a másik énje ott van az égben.
Kirishima Kano egy jókedvű, életvidám kislány, aki anyja elvesztése után nővérével, a városka orvosával, Hijirivel él. Emellett van a városnak egy aranyos kóbor kutyája, Potato, akivel szoros barátságban vannak. Kano az egyik karján egy sárga kendőt visel, amit állítása szerint nem vehet le. Kano még egy különös dologgal lepi meg Yukitot. Azt állítja, ha majd felnő, képes lesz varázsolni.
Tohno Minagi egy osztályba jár Misuzuval, remek tanuló és ő az Asztronómia klub alapítója is. A történetbe tulajdonképpen részben barátnője, Michiru miatt keveredik, aki rendre összeverekszik Yukitoval. Igazából egyik lányról se tudni sokat, első látásra Minagi nagyon titokzatos. Imádja a csillagokat, és gyakran szappanbuborékokat fúj Michiru kedvéért. Michiruról még ennyit se lehet tudni. Imádja Minagit, a főztjét és folyton vele lóg a városban, viszont úgy tűnik, egyedül él és nincs hol laknia.
Van még egy negyedik főszereplő, vele együtt összesen 3 részre osztható a történet. Az első néhány részben Kano és Minagi életét, problémáit és azoknak megoldását ismerhetjük meg. Utánuk következik annak a bizonyos lánynak a fejezete, majd végül Misuzujé.
Első látásra egy kellemes, nyugodt sorozat, hallottam már olyanokról, akik a 3-4. rész környékén fel is adták, ám ha sikerül túl jutni a 7. epizódon, a történet és a hangulat is nagyon komoly fordulatot vesz.